Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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