Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
STX4Q12846 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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STX4Q12846 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms