Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDR1Q08345 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDR1Q08345 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms