Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN11Q06124 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms