Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms