Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GBE1Q04446 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms