Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 DCTN6-201ENST00000221114 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ABRACL-201ENST00000367660 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AC007342.1-201ENST00000565073 706 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LINC00595-212ENST00000634933 1544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CACNB1Q02641 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms