Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
IRF8Q02556 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF8Q02556 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms