Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC6A3Q01959 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms