Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNC1Q01954 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNC1Q01954 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms