Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RPL23P62829 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPL23P62829 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPL23P62829 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPL23P62829 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPL23P62829 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RPL23P62829 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms