Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASP7P55210 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP7P55210 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP7P55210 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP7P55210 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP7P55210 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP7P55210 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP7P55210 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms