Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAPAP54920 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAPAP54920 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAPAP54920 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAPAP54920 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NAPAP54920 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms