Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRCA2P51587 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms