Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CENPFP49454 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CENPFP49454 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CENPFP49454 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CENPFP49454 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CENPFP49454 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CENPFP49454 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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CENPFP49454 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPFP49454 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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