Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ME1P48163 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ME1P48163 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ME1P48163 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ME1P48163 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ME1P48163 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms