Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XCR1P46094 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms