Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMPOP42166 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMPOP42166 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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