Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FDFT1P37268 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms