Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CTNNB1P35222 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms