Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRA3P34903 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms