Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms