Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TSPOP30536 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms