Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CASP1P29466 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASP1P29466 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASP1P29466 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms