Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms