Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL4P13236 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL4P13236 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCL4P13236 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCL4P13236 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms