Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF2P04141 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF2P04141 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms