Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRAMEF2O60811 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms