Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP290O15078 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CEP290O15078 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP290O15078 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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