Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EBAG9O00559 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms