Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN8O00124 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms