Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E9PBE3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E9PBE3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E9PBE3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E9PBE3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E9PBE3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E9PBE3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E9PBE3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms