Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4DXG7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B4DXG7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B4DXG7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms