Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SRRM4A7MD48 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms