Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC169A6NNP5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms