Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NPIPB13A6NJU9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms