Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A087WUJ7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A087WUJ7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms