Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
HECTD4Q9Y4D8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms