Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PKP3Q9Y446 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PKP3Q9Y446 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PKP3Q9Y446 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PKP3Q9Y446 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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