Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SH3BP1Q9Y3L3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms