Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms