Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP1Q9UPQ3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AGAP1Q9UPQ3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms