Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TUBE1Q9UJT0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms