Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HCN3Q9P1Z3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms