Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNIH4Q9P003 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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