Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG3Q9NT62 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms