Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT84Q9NSB2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms