Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCSER1Q9C0I3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms