Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLRP1Q9C000 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms