Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms